История среднего медицинского образования в Калининградской области началось 20 июня 1947 года, когда в Калининграде была открыта фельдшерско-акушерская школа. В 1954 году приказом министерства здравоохранения РСФСР фельдшерско-акушерская школа была преобразована в Калининградское медицинское училище. В 2000 году Калининградское медицинское училище было реорганизовано в Государственное образовательное учреждение среднего профессионального образования «Калининградский медицинский колледж».
В 2008 году колледж стал структурным подразделением медицинского факультета, а в настоящее время медицинского института. Руководитель медицинского института - доктор медицинских наук, профессор Сергей Владимирович Коренев.
Значительный вклад в становление и развитие медицинского образования Калининградской области внесли такие выдающиеся организаторы здравоохранения, как Вольшонок Марк Захарович, Лапидус Виктор Львович, Бирковская Юлия Дмитриевна, Кабанчук Евгений Григорьевич, Черкес Николай Николаевич.
За 70 лет своей деятельности колледж, а в дальнейшем медицинский институт выпустил 22 547 специалистов, из них:
- лечебное дело, квалификация – «фельдшер» - 6 570 человек;
- акушерское дело, квалификация – «акушерка» -6 129 человек;
- медико-профилактическое дело, квалификация – «санитарный фельдшер» - 368 человек;
- стоматология, квалификация – «зубной врач» 389 человек;
- стоматология ортопедическая, квалификация – «зубной техник» - 474 человек;
- фармация, квалификация – «фармацевт» - 338 человек;
- сестринское дело, квалификация – «медицинская сестра» - 7 521 человек;
- лабораторная диагностика, квалификация – «медицинский лабораторный техник» - 758 человек.